大山隐岐国立公园海拔 1,600 米处为灌木带，主要生长着矮紫杉一类的高山植物，毛无山与拟宝珠山上则盛开着猪牙花。
在隐岐群岛海拔较低的沿海地区，来自日本各地的植物在此共存，例如通常生长在北方的滨茄子玫瑰与通常生长在南方的名护兰。隐岐群岛也是日本海中面积最大的海草床生长地之一，同时还是本土物种隐岐小鲵的家园。
岛根半岛上的岩石海岸是海鸟繁殖的理想场所。经岛沿海则是日本最重要的黑尾鸥筑巢地点之一。
植物
猪牙花
猪牙花（学名：Erythronium japonicum）生长在温带落叶林（例如日本山毛榉与蒙古栎）之下，每年春季都会在毛无山山峰与岛后岛附近开放。
猪牙花
矮紫杉
矮紫杉（学名：Taxus cuspidate）是日本红豆杉的变种，生长在日本海沿海的群山之中。大山山顶附近的矮紫杉林已被指定为特别天然纪念物。
矮紫杉
动物
黑尾鸥
经岛位于岛根半岛西端的日御碕海湾。每年 11 月初至次年 7 月，成千上万只黑尾鸥会聚集在此处繁衍后代。您可以在日御碕观景台上观赏黑尾鸥。
黑尾鸥
隐岐小鲵
这种小鲵是隐岐群岛独有的物种。它们只生活在岛后岛的溪流中，已被指定为该镇的天然纪念物。
隐岐小鲵