이리오모테 이시가키 국립공원의 맹그로브숲과 암초에는 관수리, 중국상자거북, 쥐가오리 등 다양한 생물이 서식합니다.
이리오모테 이시가키 국립공원에는 북반구 최대 규모의 청산호 군락은 물론 일본 최대 규모의 맹그로브숲이 있습니다. 공원의 섬에는 틸리아세우스 무궁화, 판다누스, 토착종인 야에야마야자수 같은 초목이 있는 연안 삼림도 있습니다.
이런 환경으로 인해 관수리, 중국상자거북, 쥐가오리처럼 다양한 생물이 서식합니다. 또한 이리오모테산고양이 등 공원의 섬에만 서식하는 종도 있습니다. 한편 줄도마뱀은 공원의 야에야마 제도, 공원 외부에 있는 요나구니섬에서만 볼 수 있습니다.
맹그로브숲은 해수와 담수가 섞이는 지역에 형성되었으며, 아열대 기후에서만 볼 수 있습니다. 이리오모테 이시가키 국립공원에 있는 맹그로브숲에는 주로 검은맹그로브와 고리 뿌리 맹그로브가 있습니다. 이리오모테섬에 있는 나카마강에는 일본 최대 규모의 맹그로브숲이 있습니다.
쥐가오리(Manta alfredi)는 세계 최대의 가오리 품종 하나입니다. 쥐가오리는 전 세계의 열대 및 아열대 바다에 서식합니다. 야에야마 제도에서 종종 볼 수 있으며, 가비라만의 ‘만타 스크램블’이 특히 유명합니다.
이리오모테고양이(Prionailurus bengalensis iriomotensis)는 1965년 처음 알려진 품종입니다. 삵의 아종으로서 이리오모테섬에만 서식합니다. 현재 약 100여 마리만 섬에 남아 있어 심각한 멸종 위기종입니다.
