最常見的夜間交通工具就是高速巴士。旅客可以搭乘從東京出發的巴士，經由高速公路到訪各地的城市。北至北海道、南往九州，四通八達、暢行無阻。「新宿轉運站（バスタ新宿）」以及「東京車站（八重洲口）」是東京的兩大長途巴士據點。另外，澀谷、池袋、橫濱、八王子等主要車站以及東京迪士尼渡假村等地也有高速巴士停靠。利用各種巴士預約網站可以事先完成線上預約，而在各大巴士轉運站也可以購買當日車票或提前預約車票。

Due to the development of the Shinkansen network, many of Japan’s night trains have been abolished in the last 30 years, but there are some night trains that continue to operate. During the 2020 Olympic and Paralympic Games from Tokyo, you can use “Sunrise Seto” (Tokyo-Okayama-Takamatsu), “Sunrise Izumo” (Tokyo-Okayama-Izumo City), “Moonlight Nagara” (Tokyo-Ogaki) ) Three trains. All trains can use JAPAN RAIL PASS and some seats can be reserved, but it is quite difficult to secure seats and sleepers without using JAPAN RAIL PASS. The reason for this is that online reservations in foreign languages ​​are not possible, and they are so popular that they sell out quickly. In addition, the category called “Luxury Sleeper Train” is showing excitement with the decline of night trains. Famous are “Nanatsuboshi” running from Kyushu starting from Fukuoka and “Mizukaze” running from western Japan starting from Osaka, but “TRAIN SUITE Shikijima” starting from Ueno Station is the starting point in Tokyo.

交通流量少的午夜時間是有效利用高速公路跑遍日本的最佳時段。尤其是在東京奧運會及帕運會期間，為了緩解交通堵塞的情況，會將白天（早上6點到晚上10點）的高速公路通行費調高至1000日圓。而深夜（凌晨0點到4點）的時段則降至半價優惠。因此夜間的移動將更加划算喔！

並且，在東京2020奧運會及帕運會期間外，除了首都高速公路之外，如果使用其他日本的高速公路也是夜間的移動比較划算。每天的凌晨0點到4點之間使用ETC卡（高速公路電子收費系統）通過收費站※可享有30%的自動折扣。ETC卡通常附屬在日本國內發行的信用卡功能內，但海外旅客可在辦理租車手續時向汽車租賃公司租借使用。

※NEXCO東日本/中日本/西日本（NEXCO3社）管轄下的全國高速公路以及宮城縣道路公社的仙台松島道路適用此優惠。而京葉道路、第三京濱道路、橫濱新道以及橫濱橫須賀道路則不適用此折扣優惠。

從東京乘坐夜間渡輪出發，無論是日本列島最北端的北海道，或是最南端的九州地區都能前往。東京近郊可以乘坐的夜間渡輪共有4艘，都是從東京周邊的港口出發，在船內度過一晚或兩晚後，於第二天或第三天抵達目的地。

其中最便捷的路線便是每天都有渡輪往返的「八丈島」，它是位於東京南邊大約300公里的離島。此外，從茨城縣的大洗港每天有2班出發至北海道苫小牧的航線，以及經由四國的德島再抵達九州北部的新門司的航線。還有只有坐船才能抵達位於距離東京南邊約1000公里的「小笠原群島」，島上有許多珍貴的動植物棲息，擁有「東方的加拉帕戈斯」之美稱，而且小笠原群島已被列為世界自然遺產，相當值得一訪。

由於無法乘坐飛機前往小笠原群島，且渡輪的班次3天才有1班，因此想要到此一遊的話至少必須安排6天5夜的行程才足以飽覽島上風光。除此之外的其他地區多能乘坐飛機抵達，想要周遊日本的遊客不妨以不同點進出的方式，利用單趟飛機與夜間渡輪的排列組合，計劃暢遊日本吧。

每艘渡輪都具備設有床舖的客房及適合背包客的大通舖，可於搭乘日的1～2個月前在各渡輪公司網站上提前預約。